Couronnant le hameau de Saint-Germain, cette chapelle a été construite à l’extrémité occidentale du plateau de l’Isle. Elle possède encore quelques vestiges de l’époque romane. La chapelle est le dernier lieu culturel construit à Saint-Germain, elle succéda en effet à un édifice chrétien dont on connaît seulement l’époque de son remaniement : Xe – XIe siècle (en ont été retrouvés des blocs gallo-romains et des dalles carolingiennes). Il fut lui-même construit à l’emplacement d’un temple gallo-romain du Ier ou du IIe siècle de notre ère, de plan carré (six mètres de côté) et dont les soubassements étaient des blocs de choin blancs. Il était inclus à un large domaine ceint d’un enclos. Ce dernier en était le seul vestige au Ve° siècle. Cet édifice se compose d’une nef rectangulaire, d’une abside semi-circulaire plus basse que la nef, d’un campanile placé sur l’extrémité orientale du toit de la nef et d’un clocher carré sur voûte aménagée sur l’extrémité ouest du même toit. Un édifice cultuel fut construit sur la colline de Saint-Germain pour commémorer le passage de la dépouille mortelle de Saint-Germain, mort à Rome au Ve siècle. La chapelle actuelle fut construite à la fin du XIe siècle, suite à l’incendie de l’édifice carolingien. A l’origine, la nef était moins haute et l’abside n’existait pas. L’abside date du XIVe siècle, le rehaussement de la nef et le dallage datant du XVIIe siècle. Des cérémonies religieuses s’y déroulèrent jusqu’à l’Empire et reprirent au début du Second Empire, pour cesser définitivement vers 1920.
Le site de la chapelle a été inscrit à l’Inventaire des Monuments historiques en 1954. Des fouilles ont été menées de 1959 à 1964. L’association La Compagnie Saint-Germain participe depuis les années 60 à restaurer et à faire vivre le site.